Instalaste ambos por UEFI o ambos por BIOS?
Porque yo tengo un problema con dos SSD (8.1 y 10) instalados por BIOS DVD y UEFI USB respectivamente. Y luego de bootear en uno y en otro no se que pasa pero me tira bluescreen en el 10 enseguida del boot logo.
Según lo que vi en internet un conflicto entre particiones MBR/GPT y hay que configurar manualmente desde la BIOS, te aviso por las dudas de que te pase.
Lo que si es seguro es que al conectarlo en el PC familiar te va a seguir andando sin problemas.
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